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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 16:04:35, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

BOT01-103H19TR BOT01 Brassica oleracea genomic clone BOT01-103H19, genomic survey sequence.
FI753317.1:294-313
CCGGTTTGATTCTTTATGGGCGTGCCGTTG294TGGTGGTGCCACTTTTATGAGGATTGGCCAGGATCGGAGGTCTCTGGAGA
Brassica napus genome assembly, chromosome: C02.
HG994366.1:42426514-42426533
CCGGTTTGATTCTTTATGGGCGTGCCGTTG42426514TGGTGGTGCCACTTTTATGAGGATTGGCCAGGATCGGAGGTCTCTGGAGA
Trachurus trachurus genome assembly, chromosome: 8.
LR991642.1:7965945-7965964
TTCAGGAAGTAGTCAGATCCCATCATGCTT7965945TCATAAAAGTGGCACCACCACACTGCAAAAATGTTTACGATTTAACAAAA
Brassica napus cultivar Xiang5A chromosome 9.
CP123884.1:19902140-19902159
TCTCCAGAGACCTCCGATCCTGGCCAATCC19902140TCATAAAAGTGGCACCACCACAACGGCACGCCCATAAAGAATCAAACCGG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGGTGGTGCCACTTTTATGA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGGTGGTGCCACTTTTATGA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.220 | 0.211 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGGTGGTGCCACTTTTATGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.316 | 0.096 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCATAAAAGTGGCACCACCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.318 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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