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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:48:48, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Eutrigla gurnardus genome assembly, chromosome: 16.
OY741279.1:4579253-4579272
TGACTGATGCCCACGCAGCTCGTAGTCGTC4579253TGTAGCCTCTGTTGATGCTGTCTCTGATCTGTGTTTCCCACATCAGAAGC
TSA: Fagopyrum esculentum Unigene76503_laojing mRNA sequence.
JW728421.1:52-71
AAGCACCTTCTTCACCCACACTGCATCGTT52TGTAGCCTCTGTTGATGCTGGAGGAAGCCCATCGGAGCCCCCACACACCG
Thunnus albacares genome assembly, chromosome: 23.
OU607614.1:25296934-25296953
CAACATAAACAACAATGGCAGAGGCAGCAG25296934CAGCATCAACAGAGGCTACATCAGTAATAGGAGGTTGGACCAAAACACGT
Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome X.
CP130739.1:176165195-176165214
CCGAAACAGTAAAGCACCTGAAGCAATTAT176165195CAGCATCAACAGAGGCTACAGATTCACTGATTCAGGATTTCAGGTTTGTT
Spinacia oleracea subsp. turkestanica cultivar PI494751 chromosome Y.
CP130887.1:179708374-179708393
CCGAAACAGTAAAGCACCTGAAGCAATTAT179708374CAGCATCAACAGAGGCTACAGATTCACTGATTCAGGATTTCAGGTTTGTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGTAGCCTCTGTTGATGCTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGTAGCCTCTGTTGATGCTG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.208 | 0.200 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGTAGCCTCTGTTGATGCTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.313 | 0.104 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAGCATCAACAGAGGCTACA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.315 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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