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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 19:28:10, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Brassica napus unknown mRNA.
DQ062725.1:129-148
GCCCATGCTTATGCTTGGGATTAGCGTTGG129TGTCGCTTTCAACGTCATGTTTCCAGATTGGATGGTCACAGTACTCCTCA
Parietaria judaica genome assembly, chromosome: 12.
OX940871.1:17783247-17783266
GCCGATGCTCATGCTCGGCATCAGCATCGG17783247TGTCGCTTTCAACGTCATGTTCGCAGACTGGATGGTCACCGTTCTCCTCA
Epinotia demarniana genome assembly, chromosome: 16.
OX244275.1:2521170-2521189
CCACACAACGGGGTTAACTACTTTGTACCG2521170TGTCGCTTTCAACGTCATGTTAAATTGCCATATAAAGTTTTCAAACAAGC
Parietaria judaica genome assembly, chromosome: 8.
OX940867.1:12976662-12976681
TGAGGAGAACGGTGACCATCCAGTCAGCGA12976662ACATGACGTTGAAAGCGACACCGATGCTGATGCCGAGCATGAGCATCGGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGTCGCTTTCAACGTCATGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGTCGCTTTCAACGTCATGT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.341 | 0.332 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGTCGCTTTCAACGTCATGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.439 | 0.098 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACATGACGTTGAAAGCGACA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.440 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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