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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:29:47, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Arachis hypogaea Ahy.Unigene25694 mRNA sequence.
JR565513.1:365-384
TTTGGGTCACTCATAACCTTCCTCACCTTG365TTCTCCCTGCTCTCCGTAAATCACTCCAAACTCTTCAATTGGATTACTTG
Arachis hypogaea DNA, clone: NYHA00A36, cultivar: Nakateyutaka.
DE998920.1:94-113
TTTGGGTCACTCATAACCTTCCTCACCTTG94TTCTCCCTGCTCTCCGTAAATCACTCCAGTAAGAATTCATATTTTTTATC
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A07.
CP030989.1:814477-814496
TTTGGGTCACTCATAACCTTCCTCACCTTG814477TTCTCCCTGCTCTCCGTAAATCACTCCAGTAAGAATTCATATTTTTTATC
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A07.
CP030989.1:854213-854232
TTTGGGTCACTCATAACCTTCCTCACCTTG854213TTCTCCCTGCTCTCCGTAAATCACTCCAGTAAGAATTCATATTTTTTATG
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B07.
CP030999.1:1550111-1550130
TTTGGGTCACTCATAACCTTCCTCACCTTG1550111TTCTCCCTGCTCTCCGTAAATCGCTCGAGTAAGAATTCATATTTTTTATC
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 07.
CP049898.1:586595-586614
TTTGGGTCACTCATAACCTTCCTCACCTTG586595TTCTCCCTGCTCTCCGTAAATCGCTCGAGTAAGAATTCATATTTTTTATC
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A07.
CP030989.1:819885-819904
ATAAAAAAATATGAATTCTTACTGGATGGA819885TTTACGGAGAGCAGGGAGAACAAGGTGAGGAAGGTTATGAGTGACCCAGA
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A07.
CP030989.1:854505-854524
GATAAAAAATATGAATTCTTACTGGAGTGA854505TTTACGGAGAGCAGGGAGAACAAGGTGAGGAAGGTTATGAGTGACCCAAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTCTCCCTGCTCTCCGTAAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCTCCCTGCTCTCCGTAAA | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.130 | 0.121 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTCTCCCTGCTCTCCGTAAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.159 | 0.029 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTTACGGAGAGCAGGGAGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=44
0.160 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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