GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 19:39:01, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Lactuca sativa Letassy_X1_804 mRNA sequence.
JI576324.1:938-961
GAAGCAGCAGAAAAGTAACAGTAGGCTGTC938TTCTGTCTAGCAAATTTGAGCTTGTCTAATCTGTTCTCCACCACCCACCTTTCA
Lactuca saligna genome assembly, chromosome: 4.
OX465080.1:32475371-32475394
GAAGCAGCAGAAAAGTAACAGTAGGCTGTC32475371TTCTGTCTAGCAAATTTGAGCTTGTCTAATCTATTCTCCACCACCCACCTTTTA
QGF25D22.yg.ab1 QG_EFGHJ lettuce serriola Lactuca serriola cDNA clone QGF25D22, mRNA sequence.
BQ992296.1:303-326
TGAAAGGTGGGTGGTGGAGAACAGATTAGA303CAAGCTCAAATTTGCTAGACAGAAGACAGCCTACTGTTACTTTTCTGCTGCTTC
TSA: Lactuca serriola Serrassy_T_P2_12378 mRNA sequence.
JO022969.1:1683-1706
TGAAAGGTGGGTGGTGGAGAACAGATTAGA1683CAAGCTCAAATTTGCTAGACAGAAGACAGCCTACTGTTACTTTTCTGCTGCTTC
Lactuca sativa LsKS1 mRNA for ent-kaurene synthase No1, complete cds.
AB031205.1:1568-1591
TGAAAGGTGGGTGGTGGAGAACAGATTAGA1568CAAGCTCAAATTTGCTAGACAGAAGACAGCCTACTGTTACTTTTCTGCTGCTTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTCTGTCTAGCAAATTTGAGCTTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCTGTCTAGCAAATTTGAGCTTG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.174 | 0.165 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTCTGTCTAGCAAATTTGAGCTTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.304 | 0.130 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAAGCTCAAATTTGCTAGACAGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.306 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).