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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 19:33:03, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 9.
CP124723.1:5623751-5623771
AAGGATTAAATCCTGGATCTGCCTCTGTTT5623751TTGGTGCTGTAAGGGACTAAATACATGTCCTGATAATGATTTGATCTCCTC
Capsicum chinense COSII marker COS322 genomic sequence.
GU906116.1:433-453
AAGGATTAAATCCTGGATCTGCCTCTGTTT433TTGGTGCTGTAAGGGACTAAATACGTGTCCTGATAATGATTTGATCTCCTC
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 9, sequence.
AP026704.1:260929110-260929130
GAGGAGATCAAATCATTATCAGGACATGTA260929110TTTAGTCCCTTACAGCACCAAAAACAGAGGCAGATCCAGGATTTAATCCTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTGGTGCTGTAAGGGACTAAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTGGTGCTGTAAGGGACTAAA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.377 | 0.369 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTGGTGCTGTAAGGGACTAAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.452 | 0.075 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTTAGTCCCTTACAGCACCAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.453 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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