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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-12-18 13:36:30, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Cucumis melo subsp. melo EST, clone PS_38-H12-M13R.
AM717939.2:2-22
T2TTTCAAAAAGCGAACCAGCTACTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
EST11019317 CM-VEa library Cucumis melo cDNA clone VEa0012A15, mRNA sequence.
JG477604.1:81-101
CTCTTTCTTTCTCTCTCCATTCCTGTCGCT81TTTCAAAAAGCGAACCAGCTACTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
Cucumis melo isolate PI 511890 chromosome 2.
CP136103.1:3335906-3335926
CTCTTTCTTTCTCTCTCCATTCCTGTCGCT3335906TTTCAAAAAGCGAACCAGCTACTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
Cucumis melo genomic scaffold, anchoredscaffold00025.
LN681806.1:3307521-3307541
CTCTTTCTTTCTCTCTCCATTCCTGTCGCT3307521TTTCAAAAAGCGAACCAGCTACTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
Cucumis melo genomic chromosome, chr_2.
LN713256.1:3307521-3307541
CTCTTTCTTTCTCTCTCCATTCCTGTCGCT3307521TTTCAAAAAGCGAACCAGCTACTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
Lochmaea crataegi genome assembly, chromosome: 10.
OX387432.1:35124569-35124589
TCATCCATCTTTACCGAGTTTGTTTTGCCT35124569TAGCTGGTTCGCTTTTTGAAAAGCTCGAATTTCTTGGCTAAATTGCTTTCG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTTCAAAAAGCGAACCAGCTA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTTCAAAAAGCGAACCAGCTA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.339 | 0.329 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=TTTCAAAAAGCGAACCAGCTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.436 | 0.098 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=TAGCTGGTTCGCTTTTTGAAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=45
0.437 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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