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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:47:40, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Ipomoea nil cDNA clone:jmsf40l21, 5' end.
CJ749013.1:10-33
GGGCCTCTC10AAAGCCCACAAAGCTCTCATGTGTAGCGCCTCTCTCTTTCTCCATTCTCTCTCT
Ipomoea trifida cultivar NCNSP0306 chromosome 15.
CP025658.1:9049277-9049300
GTGAACCGGGCCTTGGCTTTTTAGCCTCTC9049277AAAGCCCACAAAGCTCTCATGTGTTGCGCCTCTCTCCTCTTTCTCCATTCTCTC
Ipomoea triloba cultivar NCNSP0323 chromosome 15.
CP025674.1:10873210-10873233
GTGAACCGGGCCTTGGCTTTTTAGCCTCTC10873210AAAGCCCACAAAGCTCTCATGTGTTGCGCCTCTCTCCTCTTTCTCCATTCTCTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/aaagcccacaaagctctcatgtgt
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : aaagcccacaaagctctcatgtgt | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.214 | 0.206 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAAGCCCACAAAGCTCTCATGTGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.305 | 0.090 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACACATGAGAGCTTTGTGGGCTTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.305 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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