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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:56:30, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Capsicum annuum MGMT_Contig12098, mRNA sequence.
JW062342.1:468-489
AGTAATATAAACTACGCGTTTGACATTAAC468ACATGATAAGCGCAATCTTCAGGGCCCTTGTCCAAATTGTGGAACGGAAAAT
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 1, sequence.
AP026696.1:332524711-332524732
AGTAATATAAACTACGCGTTTGACATTAAC332524711ACATGATAAGCGCAATCTTCAGGGCCCTTGTCCGAATTGTGGAACGGGAAAT
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 1.
CP124731.1:333989898-333989919
AGTAATATAAACTACGCGTTTGACATTAAC333989898ACATGATAAGCGCAATCTTCAGGGCCCTTGTCCGAATTGTGGAACGGGAAAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/acatgataagcgcaatcttcag
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : acatgataagcgcaatcttcag | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.202 | 0.193 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACATGATAAGCGCAATCTTCAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.271 | 0.069 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTGAAGATTGCGCTTATCATGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.271 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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