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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:52:02, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Ipomoea nil cDNA clone:jmsf27h23, 5' end.
CJ743573.1:9-32
GACGGTTC9CCAGTGTCTTCCCTGCAAAGTGTAGTTCTGTACNTCTAGAGAGAGATAGAGAGA
Ipomoea nil cDNA clone:jmsf52l01, 5' end.
CJ751495.1:9-32
GGCTGTTC9CCAGTGTCTTCCCTGCAAAGTGTAGTTCTGTACATCTAGAGAGAGATAGAGAGA
Ipomoea trifida cultivar NCNSP0306 chromosome 2.
CP025645.1:9582788-9582811
TTTCTATTTCTCTCTCTAGACGTACAGAAC9582788TACACTTTGCAGGGAAGACACTGGGAACAGCAGTGAAGGGGGAGACTTACTAAC
Ipomoea triloba cultivar NCNSP0323 chromosome 2.
CP025661.1:4165933-4165956
TTTCTATTTCTCTCTCTAGACGTACAGAAC4165933TACACTTTGCAGGGAAGACACTGGGAACAGCAGTGAAGGGGGAGACTTACTAAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ccagtgtcttccctgcaaagtgta
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ccagtgtcttccctgcaaagtgta | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.170 | 0.161 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCAGTGTCTTCCCTGCAAAGTGTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.198 | 0.028 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TACACTTTGCAGGGAAGACACTGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.199 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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