GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:18:41, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

BOHPA67TF BOHP Brassica oleracea genomic clone BOHPA67, genomic survey sequence.
BH571553.1:563-586
ATAACATTTCTTTCCCAAGTCATTAAGAAT563CTTAAGAGGCTTGACATGCGTCAGTTAACAGTAGATTAGAGAGAACGTAGATGG
Brassica napus cultivar Xiang5A chromosome 4.
CP123879.1:69184180-69184203
TATAACATTTCTTTCCAAAGTCATTAGAAT69184180CTTAAGAGGCTTGACATGCGTCAGTTAACAGTAGATTAGAGAGAACGTAGATGG
Brassica oleracea HDEM genome, scaffold: C8.
LR031879.1:50533887-50533910
TATAACTTTTCTTTCCAAAGTCATTAGAAT50533887CTTAAGAGGCTTGACATGCGTCAGTTAACAGTAGATTAGAGAGAACGTAGATGG
BOT01-6D7TR BOT01 Brassica oleracea genomic clone BOT01-6D7, genomic survey sequence.
FI689253.1:365-388
CCATCTACGTTCTCTCTAATCTACTGTTAA365CTGACGCATGTCAAGCCTCTTAAGATTCTTAATGACTTTGGAAAGAAATGTTAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/cttaagaggcttgacatgcgtcag
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : cttaagaggcttgacatgcgtcag | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.360 | 0.351 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTTAAGAGGCTTGACATGCGTCAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.503 | 0.142 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTGACGCATGTCAAGCCTCTTAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.504 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).