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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 16:26:55, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Ipomoea nil cDNA clone:jm34f03, 5' end, single read.
BJ561594.1:163-186
GTCGGTANTGGCGGCAGAGTCATCATCATC163GCACTCGGAAACGGAATCAATAAGTAGCTACTCATCATTATCTCCGTCTTCTTC
Ipomoea nil cDNA clone:jmsf30d07, 5' end.
CJ744898.1:159-182
GTCGGTAATGGCGGCAGAGTCATCATCATC159GCACTCGGAAACGGAATCAATAAGTAGCTACTCATCATTATCTCCGTCTTCTTC
Ipomoea nil cDNA clone:jmsf30e23, 5' end.
CJ744934.1:164-187
GTCGGTAATGGCGGCAGAGTCATCATCATC164GCACTCGGAAACGGAATCAATAAGGAGCTACTCATCATTATCTCCGTCTTCTTC
Ipomoea triloba cultivar NCNSP0323 chromosome 1.
CP025660.1:11394751-11394774
GTCGGTAATGGCGGCAGAGTCATCATCATC11394751GCACTCGGAAACGGAATCAATAAGTAGCTACTCATCATCATTATCTCCGTTTTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/cttattgattccgtttccgagtgc
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : cttattgattccgtttccgagtgc | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.161 | 0.153 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTTATTGATTCCGTTTCCGAGTGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.319 | 0.158 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCACTCGGAAACGGAATCAATAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.322 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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