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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:56:28, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

KS07018A04 KS07 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
BM066760.1:189-212
CACGCCCTGCGACGGCGCGTGAGTTAATGA189GAGTATGTAAGGAGCTAAAGGGGAGATTTGAAGAGGTCACGGTCCCATTTCTGA
KS13032G09 KS13 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD054612.1:483-506
TCAGAAATGGCACCGTGACCTCTTCAAATC483TCCCCTTTAGCTCCTTACATACTCTCATTAACTCACGCGCCGTCGCAGGGCGTG
KS25004F19 KS25 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD124197.1:460-483
TCAGAAATGGCACCGTGACCTCTTCAAATC460TCCCCTTTAGCTCCTTACATACTCTCATTAACTCACGCGCCGTCGCAGGGCGTG
TSA: Capsicum annuum MGMT_Contig33054 mRNA sequence.
JW083298.1:597-620
TCAGAAATGGCACCGTGACCTCTTCAAATC597TCCCCTTTAGCTCCTTACATACTCTCATTAACTCACGCGCCGTCGCAGGGCGTG
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 5, sequence.
AP026700.1:248399707-248399730
TCAGAAATGGCACCGTGACCTCTTCAAATC248399707TCCCCTTTAGCTCCTTACATACTCTCATTAACTCACGCGCCGTCGCAGGGCGTG
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 5.
CP124727.1:249586294-249586317
TCAGAAATGGCACCGTGACCTCTTCAAATC249586294TCCCCTTTAGCTCCTTACATACTCTCATTAACTCACGCGCCGTCGCAGGGCGTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/gagtatgtaaggagctaaagggga
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : gagtatgtaaggagctaaagggga | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.166 | 0.157 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAGTATGTAAGGAGCTAAAGGGGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.459 | 0.294 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCCCCTTTAGCTCCTTACATACTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.463 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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