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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:56:28, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

KS14023H05 KS14 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD059606.1:297-320
GCTGATCTTGATGCTCTAGGTGCCCTAGGC297GATGTTGGTTGGTACTGTATACGCGCAATCTTGTGGATTACTGATTATGAATTG
KS14036H08 KS14 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD060810.1:297-320
GCTGATCTTGATGCTCTAGGTGCCCTAGGC297GATGTTGGTTGGTACTGTATACGCGCAATCTTGTGGATTACTGATTATGAATTG
KS14037F07 KS14 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD060877.1:297-320
GCTGATCTTGATGCTCTAGGTGCCCTAGGC297GATGTTGGTTGGTACTGTATACGCGCAATCTTGTGGATTACTGATTATGAATTG
KS18050H04 KS18 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD086146.1:278-301
GCTGATCTTGATGCTCTAGGTGCCCTAGGC278GATGTTGGTTGGTACTGTATACGCGCAATCTTGTGGATTACTGATTATGAATTG
TSA: Capsicum annuum MGMT_Contig13149, mRNA sequence.
JW063393.1:244-267
GCTGATCTTGATGCTCTAGGTGCCCTAGGC244GATGTTGGTTGGTACTGTATACGCGCAATCTTGTGGATTACTGATTATGAATTG
TSA: Capsicum annuum MA_MegaContig_19767, mRNA sequence.
JW158703.1:789-812
GCTGATCTTGATGCTCTAGGTGCCCTAGGC789GATGTTGGTTGGTACTGTATACGCGCAATCTTGTGGATTACTGATTATGAATTG
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 4.
CP124728.1:39489438-39489461
GCTGATCTTGATGCTCTAGGTGCCCTAGGC39489438GATGTTGGTTGGTACTGTATACGCGCAATCTTGTGGATTACTGATTATGAATTG
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 4, sequence.
AP026699.1:213605317-213605340
CAATTCATAATCAGTAATCCACAAGATTGC213605317GCGTATACAGTACCAACCAACATCGCCTAGGGCACCTAGAGCATCAAGATCAGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/gatgttggttggtactgtatacgc
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : gatgttggttggtactgtatacgc | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.610 | 0.601 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GATGTTGGTTGGTACTGTATACGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.696 | 0.086 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCGTATACAGTACCAACCAACATC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=43
0.697 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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