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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-03-20 04:39:22, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Medicago truncatula clone mth2-9i24, complete sequence.
AC126785.11:5594-5616
GGCAAACTAATTAAACCTCTGATTAGTCTT5594TCCTATGCAATTATGTGTGACCACTTAACAACAAACAATGAATAATGCTTAAT
Medicago truncatula chromosome 5 clone mth2-18j8, COMPLETE SEQUENCE.
CR962138.3:89254-89276
GGCAAACTAATTAAACCTCTGATTAGTCTT89254TCCTATGCAATTATGTGTGACCACTTAACAACAAACAATGAATAATGCTTAAT
T135792b shotgun sub-library of BAC clone 60O16 Medicago truncatula genomic clone 60-O-16-C-024, genomic survey sequence.
AQ580192.1:62-84
ATTAAGCATTATTCATTGTTTGTTGTTAAG62TGGTCACACATAATTGCATAGGAAAGACTAATCAGAGGTTTAATTAGTTTGCC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/tcctatgcaattatgtgtgacca
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : tcctatgcaattatgtgtgacca | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.360 | 0.352 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCCTATGCAATTATGTGTGACCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.467 | 0.107 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGGTCACACATAATTGCATAGGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.467 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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