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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 20:06:25, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Malus domestica genome assembly, chromosome: 12.
OU696688.1:18041699-18041718
TGTGATGGTGGTGTTTTTAAGCTCGATCTA18041699TGAAGTATGGTGGTGCGTTCAAGAGTTCGAGTGATGAGAGAGAGAGAGAG
Malus domestica genome assembly, chromosome: 12.
OU744553.1:18045760-18045779
TGTGATGGTGGTGTTTTTAAGCTCGATCTA18045760TGAAGTATGGTGGTGCGTTCAAGAGTTCGAGTGATGAGAGAGAGAGAGAG
Malus domestica genome assembly, chromosome: 12.
OU744964.1:17604354-17604373
TGTGATGGTGGTGTTTTTAAGCTCGATCTA17604354TGAAGTATGGTGGTGCGTTCAAGAGTTCGAGTGATGAGAGAGAGAGAGAG
Malus domestica genome assembly, chromosome: 12.
OU745002.1:17769672-17769691
TGTGATGGTGGTGTTTTTAAGCTCGATCTA17769672TGAAGTATGGTGGTGCGTTCAAGAGTTCGAGTGATGAGAGAGAGAGAGAG
Malus hybrid cultivar cultivar Flame chromosome 12.
CP141938.1:14020634-14020653
TATCTTCTCTCTCTCCTCACTCGAACTCTT14020634GAACGCACCACCATACTTCATAGACCGAGCTTAAAAACACCACCATCACA
Malus x robusta genome assembly, chromosome: 13.
OY720337.1:13967196-13967215
CTCTCTCTCTCTCTCATCACTCGAACTCTT13967196GAACGCACCACCATACTTCATAGATCGAGCTTAAAAACACCACCATCACA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/tgaagtatggtggtgcgttc
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : tgaagtatggtggtgcgttc | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.232 | 0.224 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGAAGTATGGTGGTGCGTTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.331 | 0.099 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAACGCACCACCATACTTCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.332 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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