# [ GGGenome | 2024-11-21 21:01:02 ]
# database:	Rhesus pre-spliced RNA, RefSeq on Mmul_10/rheMac10, D3G 23.02 (Feb, 2023)
# query:	TTCATTGACAACATT
# count:	13
# query:	AATGTTGTCAATGAA
# count:	6
# name	strand	start	end	snippet	snippet_pos	snippet_end	query	sbjct	align	edit	match	mis	del	ins
XM_015118624.2|COX10;718301|chr16:13863555:13987221:+|prespliced::chr16:13863555-13987221(+)	+	27270	27284	AAGCTCTGTTGGTTTGGGAATATTACTCTCCTATGGGCTCCCAGAGCTATTTCTGGGCCTGCAGTGCAGTGCCTCTGGGCCTATATTAGATGGGCCATGCTTCATTGACAACATTGATTTTATGTTTATTTGTGAAAGGGCAGAATATGAGATTACCAAATAAAATATAATTTCAGGTGTTATTAATGAGGGAGTATATTGCATTCACTTTTAAT	27170	27384	TTCATTGACAACATT	TTCATTGACAACATT	|||||||||||||||	===============	15	0	0	0
NM_001194644.1|COX10;718301|chr16:13863558:14003752:+|prespliced::chr16:13863558-14003752(+)	+	27267	27281	AAGCTCTGTTGGTTTGGGAATATTACTCTCCTATGGGCTCCCAGAGCTATTTCTGGGCCTGCAGTGCAGTGCCTCTGGGCCTATATTAGATGGGCCATGCTTCATTGACAACATTGATTTTATGTTTATTTGTGAAAGGGCAGAATATGAGATTACCAAATAAAATATAATTTCAGGTGTTATTAATGAGGGAGTATATTGCATTCACTTTTAAT	27167	27381	TTCATTGACAACATT	TTCATTGACAACATT	|||||||||||||||	===============	15	0	0	0
XM_001100209.4|HESX1;704551|chr2:113356010:113384258:-|prespliced::chr2:113356010-113384258(-)	+	25584	25598	TTCCTATGAATTAATCCAGGCACTTGGAAGACAATTACACTCCGTGTTAATAACATTGCCAACCTTTTCCACTATGCTGCACTCCAAATACTATTGTGTTTTCATTGACAACATTCCCTATTACATATGCATATGAAAAACAGGCATTTTCATCAGAATTACTGTAATAGCATTAAGAGATTATTATTTTTTCCAATTTCTTTGGAAGAAAATTC	25484	25698	TTCATTGACAACATT	TTCATTGACAACATT	|||||||||||||||	===============	15	0	0	0
XM_028848051.1|TENM3;700867|chr5:178767098:180127370:+|prespliced::chr5:178767098-180127370(+)	+	1911	1925	TCCATCTCAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAGCCATATAATTAATAAAGTAGTTAATTTTGTTTGGTATTTGGACCCCCAGATCAGTCTTCATATTCTTTCATTGACAACATTCATGAAGTTCTGCAGAAATTAGATAGAATTAAGAAACAAATTCCTTTCAGAGCAAAATGACATGGTACATTCTTAGTTAAATGCTTATGTCATTCTGCAT	1811	2025	TTCATTGACAACATT	TTCATTGACAACATT	|||||||||||||||	===============	15	0	0	0
XM_028848053.1|TENM3;700867|chr5:178767098:180127370:+|prespliced::chr5:178767098-180127370(+)	+	1911	1925	TCCATCTCAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAGCCATATAATTAATAAAGTAGTTAATTTTGTTTGGTATTTGGACCCCCAGATCAGTCTTCATATTCTTTCATTGACAACATTCATGAAGTTCTGCAGAAATTAGATAGAATTAAGAAACAAATTCCTTTCAGAGCAAAATGACATGGTACATTCTTAGTTAAATGCTTATGTCATTCTGCAT	1811	2025	TTCATTGACAACATT	TTCATTGACAACATT	|||||||||||||||	===============	15	0	0	0
XM_028848054.1|TENM3;700867|chr5:178767098:180127370:+|prespliced::chr5:178767098-180127370(+)	+	1911	1925	TCCATCTCAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAGCCATATAATTAATAAAGTAGTTAATTTTGTTTGGTATTTGGACCCCCAGATCAGTCTTCATATTCTTTCATTGACAACATTCATGAAGTTCTGCAGAAATTAGATAGAATTAAGAAACAAATTCCTTTCAGAGCAAAATGACATGGTACATTCTTAGTTAAATGCTTATGTCATTCTGCAT	1811	2025	TTCATTGACAACATT	TTCATTGACAACATT	|||||||||||||||	===============	15	0	0	0
XM_028848055.1|TENM3;700867|chr5:178767098:180127370:+|prespliced::chr5:178767098-180127370(+)	+	1911	1925	TCCATCTCAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAGCCATATAATTAATAAAGTAGTTAATTTTGTTTGGTATTTGGACCCCCAGATCAGTCTTCATATTCTTTCATTGACAACATTCATGAAGTTCTGCAGAAATTAGATAGAATTAAGAAACAAATTCCTTTCAGAGCAAAATGACATGGTACATTCTTAGTTAAATGCTTATGTCATTCTGCAT	1811	2025	TTCATTGACAACATT	TTCATTGACAACATT	|||||||||||||||	===============	15	0	0	0
XM_028848056.1|TENM3;700867|chr5:178767098:180127370:+|prespliced::chr5:178767098-180127370(+)	+	1911	1925	TCCATCTCAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAGCCATATAATTAATAAAGTAGTTAATTTTGTTTGGTATTTGGACCCCCAGATCAGTCTTCATATTCTTTCATTGACAACATTCATGAAGTTCTGCAGAAATTAGATAGAATTAAGAAACAAATTCCTTTCAGAGCAAAATGACATGGTACATTCTTAGTTAAATGCTTATGTCATTCTGCAT	1811	2025	TTCATTGACAACATT	TTCATTGACAACATT	|||||||||||||||	===============	15	0	0	0
XM_028848057.1|TENM3;700867|chr5:178767098:180127370:+|prespliced::chr5:178767098-180127370(+)	+	1911	1925	TCCATCTCAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAGCCATATAATTAATAAAGTAGTTAATTTTGTTTGGTATTTGGACCCCCAGATCAGTCTTCATATTCTTTCATTGACAACATTCATGAAGTTCTGCAGAAATTAGATAGAATTAAGAAACAAATTCCTTTCAGAGCAAAATGACATGGTACATTCTTAGTTAAATGCTTATGTCATTCTGCAT	1811	2025	TTCATTGACAACATT	TTCATTGACAACATT	|||||||||||||||	===============	15	0	0	0
XM_028848058.1|TENM3;700867|chr5:178767098:180127370:+|prespliced::chr5:178767098-180127370(+)	+	1911	1925	TCCATCTCAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAGCCATATAATTAATAAAGTAGTTAATTTTGTTTGGTATTTGGACCCCCAGATCAGTCTTCATATTCTTTCATTGACAACATTCATGAAGTTCTGCAGAAATTAGATAGAATTAAGAAACAAATTCCTTTCAGAGCAAAATGACATGGTACATTCTTAGTTAAATGCTTATGTCATTCTGCAT	1811	2025	TTCATTGACAACATT	TTCATTGACAACATT	|||||||||||||||	===============	15	0	0	0
XM_028848059.1|TENM3;700867|chr5:178767098:180127370:+|prespliced::chr5:178767098-180127370(+)	+	1911	1925	TCCATCTCAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAGCCATATAATTAATAAAGTAGTTAATTTTGTTTGGTATTTGGACCCCCAGATCAGTCTTCATATTCTTTCATTGACAACATTCATGAAGTTCTGCAGAAATTAGATAGAATTAAGAAACAAATTCCTTTCAGAGCAAAATGACATGGTACATTCTTAGTTAAATGCTTATGTCATTCTGCAT	1811	2025	TTCATTGACAACATT	TTCATTGACAACATT	|||||||||||||||	===============	15	0	0	0
XM_015139652.2|F11;702117|chr5:183545316:183572015:+|prespliced::chr5:183545316-183572015(+)	+	12638	12652	CAGGCTGGTCTAGAACTGCTGGCCTCAAGCAATCCATCGGCCATGGCCTCCCACAGTGCAGGGATTACAAGCCTGAGCCACCATGCCCAGCTTGCTATTCTTCATTGACAACATTCACTTAAACAAACAAACATCCATAAAATTAAGTCAGTTTTAAAACCTAGCTTGTATATATCTTTGAATTGGAACTCTCAGAGCCTTCAGCACTTGCTTGA	12538	12752	TTCATTGACAACATT	TTCATTGACAACATT	|||||||||||||||	===============	15	0	0	0
XM_015139653.2|F11;702117|chr5:183545316:183572015:+|prespliced::chr5:183545316-183572015(+)	+	12638	12652	CAGGCTGGTCTAGAACTGCTGGCCTCAAGCAATCCATCGGCCATGGCCTCCCACAGTGCAGGGATTACAAGCCTGAGCCACCATGCCCAGCTTGCTATTCTTCATTGACAACATTCACTTAAACAAACAAACATCCATAAAATTAAGTCAGTTTTAAAACCTAGCTTGTATATATCTTTGAATTGGAACTCTCAGAGCCTTCAGCACTTGCTTGA	12538	12752	TTCATTGACAACATT	TTCATTGACAACATT	|||||||||||||||	===============	15	0	0	0
XM_001084620.3|SYT1;695390|chr11:78464657:79062480:+|prespliced::chr11:78464657-79062480(+)	-	244673	244687	TAAATGAATACAAAAGTATAAAATATATACCAACAAGGTATTTCCAATAATACATTAATGTATTGATGAGGTAAGATAGGTTTGTTCCAGAAGTTTAAAAAATGTTGTCAATGAATTTGATAAAATTTAATATTCACATTAGAAGTATTACCATTAAAACCAAAATATGACATACTTATTCTCTTCATTATTTTGGAATAGAAAAAATTATTCTT	244573	244787	AATGTTGTCAATGAA	AATGTTGTCAATGAA	|||||||||||||||	===============	15	0	0	0
XM_015152349.2|SYT1;695390|chr11:78464662:79062480:+|prespliced::chr11:78464662-79062480(+)	-	244668	244682	TAAATGAATACAAAAGTATAAAATATATACCAACAAGGTATTTCCAATAATACATTAATGTATTGATGAGGTAAGATAGGTTTGTTCCAGAAGTTTAAAAAATGTTGTCAATGAATTTGATAAAATTTAATATTCACATTAGAAGTATTACCATTAAAACCAAAATATGACATACTTATTCTCTTCATTATTTTGGAATAGAAAAAATTATTCTT	244568	244782	AATGTTGTCAATGAA	AATGTTGTCAATGAA	|||||||||||||||	===============	15	0	0	0
XM_015152348.2|SYT1;695390|chr11:78464704:79062480:+|prespliced::chr11:78464704-79062480(+)	-	244626	244640	TAAATGAATACAAAAGTATAAAATATATACCAACAAGGTATTTCCAATAATACATTAATGTATTGATGAGGTAAGATAGGTTTGTTCCAGAAGTTTAAAAAATGTTGTCAATGAATTTGATAAAATTTAATATTCACATTAGAAGTATTACCATTAAAACCAAAATATGACATACTTATTCTCTTCATTATTTTGGAATAGAAAAAATTATTCTT	244526	244740	AATGTTGTCAATGAA	AATGTTGTCAATGAA	|||||||||||||||	===============	15	0	0	0
XM_015152346.2|SYT1;695390|chr11:78464731:79062480:+|prespliced::chr11:78464731-79062480(+)	-	244599	244613	TAAATGAATACAAAAGTATAAAATATATACCAACAAGGTATTTCCAATAATACATTAATGTATTGATGAGGTAAGATAGGTTTGTTCCAGAAGTTTAAAAAATGTTGTCAATGAATTTGATAAAATTTAATATTCACATTAGAAGTATTACCATTAAAACCAAAATATGACATACTTATTCTCTTCATTATTTTGGAATAGAAAAAATTATTCTT	244499	244713	AATGTTGTCAATGAA	AATGTTGTCAATGAA	|||||||||||||||	===============	15	0	0	0
XM_001100761.4|LOC704111;704111|chr19_NW_021160375v1_random:146198:160055:-|prespliced::chr19_NW_021160375v1_random:146198-160055(-)	-	1565	1579	CAGAAATGACTGCAATGCACTCCCTCTATGCCAGGTTCTTTGGTAAGTAAGTACTCTACATGACTTATTGCATTGCCAGGAGAGCTGTTAACATTATACTAATGTTGTCAATGAAAAGCTAAGATAGGCCGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATGACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCC	1465	1679	AATGTTGTCAATGAA	AATGTTGTCAATGAA	|||||||||||||||	===============	15	0	0	0
XR_001445025.2|LOC106998534;106998534|chr5:146514149:146527572:-|prespliced::chr5:146514149-146527572(-)	-	218	232	TCAGAAGGAACAAGTACCCACTATTCCTGTCATTTTAAAGGAAAGAAACAAGGACCATTATTTCCTTGGCTTAATATTAATATTAAATGGATGCCCACAAAATGTTGTCAATGAAAATCTGTGTTCAAAGCGATAATATATTCTGGAATGCTTGGCTCAGAGTTTTCTTAAGAAACAGCTCCTAAAATAATGGAGTTTAGGACAAAATTTCTGAA	118	332	AATGTTGTCAATGAA	AATGTTGTCAATGAA	|||||||||||||||	===============	15	0	0	0